På Karolinska Institutet finns det 15 anläggningar för försöksdjursverksamhet, då även Södersjukhuset, S:t Eriks Ögonsjukhus, Karolinska Sjukhuset samt Huddinge sjukhus ingår.
På Karolinska Institutets campus i Solna finns ett stort ombyggt djurhus som blev klart 2013, Wallenberglaboratoriet, som drivs av Komparativ Medicin. Anläggningen är 6000 kvadratmeter stor och det finns plats för cirka 16.000 burar. På djurhuset finns idag 6 olika avdelningar som stallar möss, råttor, smågnagare och fiskar.
Omkring 50 000 djur används varje år i djurförsök på Karolinska Institutet och 95% av dem är råttor och möss, 2 % marsvin och resten utgörs av apor, grisar, får, illrar, sorkar, kaniner och fiskar.
De djuravdelningar/djurhus som finns på KI Campus i Solna är Institutionen för cell- och molekylärbiologi (CMB), Institutionen för fysiologi och farmakologi, Institutionen för mikrobiologi, tumör- och cellbiologi (MTC), Institutionen för neurovetenskap, Scheele Djurhus (Institutionen för medicinsk biokemi och biofysik) samt Astrid Fagraeus Laboratorium, som tidigare tillhörde Smittskyddsinstitutet och fått mycket kritik för sin aphållning.